La pédagogie mise en place alterne cours fondamentaux, travaux dirigés, projets tutorés et stages en entreprise. L'équipe pédagogique est formée d'enseignant chercheurs en mathématique et informatique.

Les deux premières années du cycle ingénieur (semestres 5 à 8) apportent de solides connaissances généralistes dans le domaine des mathématiques appliquées et de l'informatique. Une importance particulière est donnée au developpement individuel des élèves par des cours en sciences humaines et sociales (communication, langues étrangères, économie, théatre, ...)

La dernière année (semestres 9 et 10) permet au futur ingénieur d'affiner son projet professionnel : grâce à un système optionnel de cours dont certains sont issus de collaboration avec d'autres formations de l'Université Blaise Pascal, il est possible de se spécialiser dans différents secteurs d'acitivités (R&D de grandes entreprise, finance, santé, logistique, informatique, ...). Le semestre 10 est entièrement consacré au stage en entreprise, point d'orgue de la formation.